Хостел «НИИ Бурденко» удобно расположен в Тверском районе Москвы, в 3,5 км от Большого театра, в 4 км от Государственного исторического музея и в 4,5 км от дома-музея В. М. Васнецова. Хостел находится примерно в 5,2 км от Красной площади, в 5,2 км от мавзолея В. И. Ленина и в 5,2 км от Музея изобразительных искусств имени А. С. Пушкина. На территории обустроена общая кухня и работает бесплатный Wi-Fi.
В номерах установлены телевизоры. Предоставляется постельное белье.
Собор Василия Блаженного находится в 5,3 км от хостела «НИИ Бурденко», а стадион «ВТБ Арена – Центральный стадион "Динамо"» — в 5,4 км. Расстояние до международного аэропорта Шереметьево составляет 28 км.